Mezi nimi jsou značné rozdílyNízkodusíkové parní kotlea běžné kotle. Hlavní rozdíly spočívají v technologii spalování, emisních ukazatelích a provozních požadavcích. Navíc jsou kompatibilní s různými environmentálními politikami a nelze je jednoduše vzájemně nahradit.
Nejzásadnějším rozdílem je koncentrace emisí oxidů dusíku (NOₓ). Běžné kotle využívají relativně tradiční metody spalování, s emisemi NOₓ obvykle přesahujícími 400 mg/m³, což ztěžuje splnění současných přísných ekologických norem. Naproti tomu nízko-dusíkové kotle dokážou regulovat emise v rozsahu 30–80 mg/m³ optimalizací struktury spalování (jako je postupné spalování a recirkulace spalin) nebo použitím technologie plně předem smíchaného spalování, plně v souladu s místními environmentálními požadavky.
Jejich konstrukce spalovacího systému se také liší. Hořáky parních kotlů s nízkým-dusíkem jsou přesnější a vyžadují přesné řízení poměru směsi vzduch-paliva a teploty spalování, aby se snížila tvorba NOₓ při vysokých teplotách. Na druhou stranu hořáky běžných kotlů mají relativně jednoduchou konstrukci, zaměřenou na tepelný výkon se slabou kontrolou přesnosti spalování.
Kromě toho mezi nimi existují rozdíly v provozních nákladech a použitelných scénářích. Parní kotle s nízkým-dusíkem mají vyšší počáteční pořizovací cenu, ale mohou pomoci vyhnout se ekologickým pokutám a některé regiony na ně nabízejí ekologické dotace. Běžné kotle mají nižší pořizovací náklady, ale nelze je již používat v oblastech s přísnými ekologickými předpisy. Z dlouhodobého-hlediska jsou parní kotle s nízkým obsahem dusíku vhodnější pro scénáře vyžadující nepřetržitý provoz, jako je průmyslová výroba a vytápění, a staly se hlavní volbou podle politických pokynů.

